Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CLOCKO15516 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CLOCKO15516 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms