Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCF2LO15068 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms