Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA3EO15041 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA3EO15041 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms