Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLGNO14967 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLGNO14967 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLGNO14967 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLGNO14967 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLGNO14967 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLGNO14967 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLGNO14967 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLGNO14967 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms