Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APAF1O14727 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APAF1O14727 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APAF1O14727 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APAF1O14727 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APAF1O14727 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APAF1O14727 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APAF1O14727 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APAF1O14727 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APAF1O14727 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
APAF1O14727 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
APAF1O14727 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
APAF1O14727 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
APAF1O14727 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APAF1O14727 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APAF1O14727 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APAF1O14727 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APAF1O14727 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APAF1O14727 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APAF1O14727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APAF1O14727 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APAF1O14727 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms