Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
O00370 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
O00370 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
O00370 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
O00370 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
O00370 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
O00370 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
O00370 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
O00370 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
O00370 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
O00370 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
O00370 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
O00370 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms