Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX39AO00148 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX39AO00148 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms