Protein–RNA interactions for Protein: H3BRM9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRM9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BRM9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BRM9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BRM9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H3BRM9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H3BRM9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H3BRM9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3BRM9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3BRM9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H3BRM9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H3BRM9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3BRM9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3BRM9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms