Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
F8VWA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
F8VWA3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
F8VWA3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
F8VWA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
F8VWA3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
F8VWA3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
F8VWA3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VWA3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VWA3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VWA3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VWA3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VWA3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
F8VWA3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms