Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E5RI56 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E5RI56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E5RI56 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E5RI56 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E5RI56 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E5RI56 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E5RI56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E5RI56 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E5RI56 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E5RI56 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
E5RI56 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
E5RI56 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
E5RI56 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms