Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM238C9JI98 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms