Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms