Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
A8MVJ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
A8MVJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
A8MVJ9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
A8MVJ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
A8MVJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
A8MVJ9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
A8MVJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
A8MVJ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms