Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
WASHC1A8K0Z3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
WASHC1A8K0Z3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms