Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP27XA6NNY8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP27XA6NNY8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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