Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DBX1A6NMT0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DBX1A6NMT0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms