Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM23A6NLE4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM23A6NLE4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms