Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGAP42A6NI28 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGAP42A6NI28 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms