Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA6L3A6NEY3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms