Protein–RNA interactions for Protein: A6NDS4

TBC1D3B, TBC1 domain family member 3B, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3BA6NDS4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBC1D3BA6NDS4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBC1D3BA6NDS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms