Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYNDIG1LA6NDD5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYNDIG1LA6NDD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms