Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM223A0PJW6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM223A0PJW6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM223A0PJW6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM223A0PJW6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM223A0PJW6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM223A0PJW6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms