Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F8A0AVK6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms