Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0D9SFI3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0D9SFI3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms