Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AR-202ENST00000396043 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AL353759.1-201ENST00000635439 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CNGA3-203ENST00000393504 3841 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 NMT1-213ENST00000592782 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CFAP52-201ENST00000352665 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKOR2Q2VWA4 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms