Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 HCG2040054-202ENST00000439182 362 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL365259.1-204ENST00000606001 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC053503.6-201ENST00000623864 1843 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NICN1Q9BSH3 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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