Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RAP1GAP2-204ENST00000542807 3110 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ACTN3-201ENST00000502692 3084 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC016590.1-205ENST00000612804 2303 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZNF608-210ENST00000613878 3190 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AKNAD1-202ENST00000369995 2641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ABI1-204ENST00000376138 3503 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KRIT1-201ENST00000340022 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CARS-202ENST00000380525 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SNX16-203ENST00000396330 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PIGO-201ENST00000298004 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC4A9-204ENST00000506757 3277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC01845-201ENST00000518418 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C8A-201ENST00000361249 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL353616.1-201ENST00000436315 2860 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ANKRD42-203ENST00000393392 2302 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC01429-201ENST00000438154 2326 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MASTL-201ENST00000342386 2968 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 EMP1-202ENST00000396301 675 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ELOVL7-201ENST00000425382 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GFM1-201ENST00000264263 3453 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HIST1H3G-201ENST00000614378 2411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CICP5-201ENST00000424045 2215 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LHX6-203ENST00000373755 3384 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AK5-202ENST00000344720 3929 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AOC3-206ENST00000613571 3900 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CYP11B2-201ENST00000323110 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PALM2-202ENST00000374531 4492 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CALCOCO1-202ENST00000430117 2706 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RHOXF2B-201ENST00000371402 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 THAP5-201ENST00000313516 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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