Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ZMYND11-203ENST00000381591 4229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PRR19-202ENST00000499536 1956 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 TBC1D3I-201ENST00000616671 1982 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AL590434.1-201ENST00000641402 1886 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 LYPD5-201ENST00000377950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CCDC175-202ENST00000537690 2616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PAAF1-214ENST00000544552 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SCNN1A-203ENST00000360168 3481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 MIR3610-201ENST00000582903 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 CD300LF-202ENST00000326165 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 GP1BA-201ENST00000329125 2501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA7-202ENST00000617050 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 OR13A1-203ENST00000553795 2078 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AL117378.1-201ENST00000454596 2305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SKOR2Q2VWA4 AL021392.1-201ENST00000426112 2949 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms