Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 INPP5B-203ENST00000373024 3060 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AFG3L1P-214ENST00000454997 3327 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 CTAGE8-201ENST00000487179 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NOL12-201ENST00000359114 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 THAP1-201ENST00000254250 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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LSAMPQ13449 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 GJB1-202ENST00000374022 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 HEXA-AS1-201ENST00000567598 2676 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KIFAP3-206ENST00000538366 3159 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ADAM22-201ENST00000265727 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 ZNF2-203ENST00000614034 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SIRT1-204ENST00000432464 3587 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AL137786.1-201ENST00000553378 3030 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 LINC00877-203ENST00000468646 2506 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
LSAMPQ13449 SALL2-207ENST00000614342 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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