Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PRR13-208ENST00000549740 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 WISP3-208ENST00000604763 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL590096.1-202ENST00000618162 580 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KITLG-203ENST00000357116 565 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 APOBEC3F-202ENST00000381565 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AP006287.1-201ENST00000533995 653 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DSTYK-203ENST00000615388 1042 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GNG14-202ENST00000640151 425 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL445675.1-201ENST00000603868 1410 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL139390.1-201ENST00000423568 517 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC090826.3-201ENST00000611178 834 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 Metazoa_SRP.68-201ENST00000612673 282 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRTAP4-9-202ENST00000617453 558 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TPD52L3-203ENST00000381428 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 L3MBTL3-207ENST00000529410 4518 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SARNP-201ENST00000336133 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC005730.1-201ENST00000434406 344 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ACOT9-207ENST00000492081 683 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms