Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 G2E3-212ENST00000553504 3796 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NIPSNAP2O75323 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms