Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NICN1Q9BSH3 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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