Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC025682.1-204ENST00000580045 733 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MIR4327-201ENST00000581194 85 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TRAV2-201ENST00000390424 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PPIL3-204ENST00000409361 897 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC110058.1-201ENST00000530389 563 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZBTB37-202ENST00000367702 1337 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AL355001.1-201ENST00000422148 444 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC118553.1-201ENST00000454219 655 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CEACAM22P-202ENST00000455058 1021 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRXP46100 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OR2T1-201ENST00000366474 1110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 IGKV6-21-201ENST00000390256 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 KRT18P12-201ENST00000425245 1273 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 IL18-202ENST00000524595 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 IGKV2D-28-202ENST00000558026 306 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 TMED1-204ENST00000588289 541 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC093159.2-201ENST00000603429 636 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 CBR3-AS1-205ENST00000608622 586 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRXP46100 AC004494.2-201ENST00000623168 830 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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