Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
RAG2P55895 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
RAG2P55895 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms