Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TTC32-202ENST00000402414 735 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC092966.1-201ENST00000414895 526 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL356481.1-201ENST00000434999 578 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZEB2P1-201ENST00000515048 1141 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC131009.2-201ENST00000542763 770 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC090409.1-202ENST00000586949 653 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 EPPK1-201ENST00000568225 15530 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RBM14-203ENST00000409372 876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL117350.1-201ENST00000418348 640 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PROCA1-204ENST00000439862 1137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ADCY10-203ENST00000476818 703 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC078880.3-201ENST00000603439 1121 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CPA4-210ENST00000493259 1512 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RPLP1P13-201ENST00000434567 299 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL392023.1-201ENST00000555655 531 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TTN-AS1-236ENST00000590040 855 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NXPE4-201ENST00000375478 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HSD17B3-202ENST00000375263 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HNRNPH1P1-201ENST00000403291 1185 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LY86-AS1-203ENST00000447858 938 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC023794.3-201ENST00000514503 564 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms