Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAPN2P17655 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms