Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
USH1CQ9Y6N9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USH1CQ9Y6N9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms