Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms