Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAD54BQ9Y620 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD54BQ9Y620 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms