Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AFG3L2Q9Y4W6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFG3L2Q9Y4W6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms