Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAB1Q9Y478 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRKAB1Q9Y478 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRKAB1Q9Y478 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms