Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms