Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CAB39Q9Y376 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAB39Q9Y376 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms