Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAN1Q9Y2M0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAN1Q9Y2M0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAN1Q9Y2M0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms