Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC3AQ9Y2H6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC3AQ9Y2H6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms