Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIGD1AQ9Y241 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms