Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC2Q9Y235 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC2Q9Y235 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms