Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SORCS3Q9UPU3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS3Q9UPU3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms