Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PHF8Q9UPP1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PHF8Q9UPP1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PHF8Q9UPP1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms