Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM33Q9UPN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM33Q9UPN9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms